Pomysł na serial jest oparty na książce Jamesa Gurneya. Bohaterami są dwaj bracia Carl i David. Początek filmu rozpoczyna się w momencie, kiedy bogaty ojciec Frank Scott wyrusza ze swoimi synami w podróż samolotem. Niestety wyprawa rodzinna kończy się prawie tragicznie. W okolicach Karaibów ich samolot rozbija się. Przeżyli tylko młodzi chłopcy, ojciec nie uszedł cało z katastrofy. Wyspa na której się rozbili, okazała się tajemniczą krainą leżącą na środku oceanu. Okazuje się, że jest to wyspa gdzie żyją dinozaury, które żyły w zamierzchłych czasach. Ale to nie wszystko bo te dinozaury nie tylko nie wyginęły, ale były bardzo inteligentne i obdarzone rozumem tak jak ludzie. Zaprzyjaźniają się z dinozaurem, który zna siedemnaście języków i ma na imię Zippo. Opowiada chłopcom o swojej krainie, do której trafili. Nie słyszeli nawet, że istnieje Dinotopia. Poznają tam też Marion, której ojciec zapisał od razu naszych bohaterów do akademii, żeby nauczyli się jak żyć w ich świecie, którego wcale nie znali. Ale taka szczęśliwa bajkowa kraina Dinotopia też miała swoje słabe strony. Mieszkańców nie omijały kłopoty. Okazało się, że nie wszystkie dinozaury były miłe i dobre. Groźnymi zabójcami były Tyranozaury, przed którymi trzeba było się ukrywać. Jednak największym problemem tej krainy była energia, która utrzymywała życie na wyspie i powoli ulegała wyczerpaniu. Tylko chłopcy mogą uratować Dinotopię, bo tylko oni mogą wejść do podziemnego świata. Czy zdążą uratować Dinotopię?